140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0111 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0111  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1345  thioesterase-like protein  63.78 
 
 
167 aa  190  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175488  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  28.23 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  27.91 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.91 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  29.03 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  28.23 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.67 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0155  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.38 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28 
 
 
134 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  24.39 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
150 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  24.03 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  24.43 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.9 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  19.7 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.21 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  27.56 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.21 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  24.29 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.44 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.2 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  25.52 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  24.19 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.2 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  25.95 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  20 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02481  thioesterase  26.98 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
166 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.62 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02021  thioesterase  27.42 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0211795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.62 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.62 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.62 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  23.62 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2260  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2770  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397297  normal  0.706445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.17 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  23.39 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  23.39 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  23.39 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  23.39 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  23.39 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  23.39 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.62 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  23.14 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.58 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  23.39 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  23.44 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.22 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  22.88 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>