25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0053 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0053  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157979  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0775  FAD dependent oxidoreductase  37.54 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0623851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  23.53 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  23.28 
 
 		 427 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  31.28 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  24.21 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.73 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.86 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  24.46 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.63 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1701  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00120296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  24.57 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.87 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  24.29 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  25.78 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  25.78 
 
 		 396 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 		 652 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.56 
 
 		 667 aa  42.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>