16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0775 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0775  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0623851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0053  FAD dependent oxidoreductase  37.54 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.85 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.75 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.1 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.1 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.1 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.1 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.1 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.97 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.54 
 
 		 434 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.27 
 
 		 434 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.27 
 
 		 434 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.25 
 
 		 416 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.27 
 
 		 434 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.25 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>