36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4197 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0396  hypothetical protein  46.26 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.967914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0306  hypothetical protein  45.97 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4040  hypothetical protein  37.25 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.747352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3843  hypothetical protein  36.69 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00510604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3647  hypothetical protein  35.94 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4158  hypothetical protein  37.29 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00164338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4065  hypothetical protein  37.29 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0398586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3963  hypothetical protein  37.09 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0297  hypothetical protein  34.8 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0405  hypothetical protein  34.24 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0143721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3661  hypothetical protein  35.47 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00533969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0326  hypothetical protein  50 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0281  hypothetical protein  49.21 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0260  hypothetical protein  57.65 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000397247  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  65.15 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  47.14 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  47.14 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  31.18 
 
 		 489 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  38.38 
 
 		 1261 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  55.36 
 
 		 539 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  47.62 
 
 		 926 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  38.78 
 
 		 882 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  39.81 
 
 		 525 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  22.3 
 
 		 928 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  47.46 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  53.7 
 
 		 613 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  32.47 
 
 		 772 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  19.58 
 
 		 685 aa  43.9  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  56.86 
 
 		 611 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  56.86 
 
 		 611 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  32.93 
 
 		 991 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.51 
 
 		 522 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  38.71 
 
 		 630 aa  43.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  33.08 
 
 		 480 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  39.02 
 
 		 535 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>