20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0396 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.967914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4197  hypothetical protein  71.65 
 
 		 291 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0260  hypothetical protein  68.25 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000397247  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0306  hypothetical protein  44.95 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4040  hypothetical protein  38.25 
 
 		 278 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.747352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3647  hypothetical protein  38.12 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3843  hypothetical protein  37.81 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00510604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0297  hypothetical protein  37.3 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0405  hypothetical protein  34.97 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0143721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3661  hypothetical protein  36.49 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00533969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3963  hypothetical protein  49.65 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4065  hypothetical protein  49.65 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0398586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4158  hypothetical protein  49.3 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00164338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0326  hypothetical protein  54.4 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0281  hypothetical protein  48.41 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  42 
 
 		 857 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  37.21 
 
 		 882 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  65.71 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  48.72 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  50 
 
 		 444 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>