19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0306 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4197  hypothetical protein  45.89 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0396  hypothetical protein  41.03 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.967914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0260  hypothetical protein  46.39 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000397247  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0143721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4040  hypothetical protein  37.97 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.747352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3963  hypothetical protein  38.1 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4158  hypothetical protein  37.72 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00164338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4065  hypothetical protein  37.76 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0398586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3843  hypothetical protein  36.08 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00510604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3647  hypothetical protein  36.93 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0297  hypothetical protein  36.51 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0326  hypothetical protein  33.12 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0281  hypothetical protein  34.42 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3661  hypothetical protein  49.61 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00533969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3325  hypothetical protein  45.07 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000609082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1261 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  44.87 
 
 		 926 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  37.1 
 
 		 630 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>