34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3325 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000609082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0306  hypothetical protein  38.63 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4040  hypothetical protein  39.25 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.747352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3843  hypothetical protein  35.22 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00510604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3963  hypothetical protein  38.91 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4158  hypothetical protein  39.12 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00164338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4065  hypothetical protein  38.57 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0398586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3647  hypothetical protein  34.87 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0260  hypothetical protein  51.15 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000397247  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0405  hypothetical protein  31.11 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0143721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0326  hypothetical protein  49.61 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3661  hypothetical protein  36.49 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00533969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  34.86 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  27.33 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  33.33 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.28 
 
 		 489 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  47.83 
 
 		 539 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  35.9 
 
 		 991 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0297  hypothetical protein  41.51 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  30.95 
 
 		 1281 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  58.7 
 
 		 613 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4197  hypothetical protein  68.97 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  29.69 
 
 		 938 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  33.33 
 
 		 833 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  35.42 
 
 		 897 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  58.7 
 
 		 611 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  58.7 
 
 		 611 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1281  hypothetical protein  39.51 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  47.89 
 
 		 525 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.59 
 
 		 2449 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.5 
 
 		 926 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03550  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1602 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.88 
 
 		 1888 aa  42.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>