35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4061 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 393 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  76.77 
 
 		 385 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  74.87 
 
 		 382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  74.14 
 
 		 385 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  73.54 
 
 		 424 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  72.44 
 
 		 386 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  72.7 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  72.25 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  70.19 
 
 		 373 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  72.18 
 
 		 386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.72 
 
 		 385 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  71.47 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  72.73 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  71.2 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  36.65 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  40 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  36.49 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  37.6 
 
 		 373 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  32.82 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  33.33 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  32.24 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  32.11 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  31.38 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  34.48 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  30.26 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  31.27 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.46 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  28.67 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  30.59 
 
 		 513 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  29.33 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  31.44 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  38.89 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3570  sulfate transporter  24.56 
 
 		 756 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  29.22 
 
 		 586 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  26.71 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>