32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0536 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  96.63 
 
 
424 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  100 
 
 
385 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  92.75 
 
 
386 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  93.01 
 
 
386 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  92.23 
 
 
386 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  85.75 
 
 
386 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  85.49 
 
 
386 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  85.49 
 
 
386 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  84.72 
 
 
386 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.14 
 
 
393 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  73.17 
 
 
382 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  72.36 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  73.48 
 
 
373 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.81 
 
 
385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  37.26 
 
 
372 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  39.84 
 
 
373 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  38.19 
 
 
382 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  33.95 
 
 
396 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.18 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  34.2 
 
 
440 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  33.52 
 
 
379 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  32.78 
 
 
374 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.24 
 
 
399 aa  142  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  34.07 
 
 
377 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  33.11 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  30 
 
 
513 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  31.6 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  33.21 
 
 
376 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  28.19 
 
 
475 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  33.22 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  30.96 
 
 
367 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>