40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1994 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  100 
 
 
373 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  44.48 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  39.84 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  40.64 
 
 
386 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  39.84 
 
 
424 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  39.57 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  39.3 
 
 
386 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  38.93 
 
 
373 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  37.4 
 
 
382 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.6 
 
 
393 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.78 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  38.34 
 
 
385 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  39.56 
 
 
386 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  39.56 
 
 
386 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  39.29 
 
 
386 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  38.74 
 
 
386 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  35.46 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.21 
 
 
385 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  35.95 
 
 
440 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  34.3 
 
 
475 aa  163  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  33.73 
 
 
379 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  32.7 
 
 
374 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  39.01 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  34.65 
 
 
349 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  33.77 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  33.79 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  31.91 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  41.8 
 
 
382 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  36.18 
 
 
367 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  28.7 
 
 
513 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  34.81 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.84 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0631  putative sulfate transporter  26.51 
 
 
527 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  26.92 
 
 
495 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14611  putative sulfate transporter  26.51 
 
 
514 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324968  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  29.55 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  24.14 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  28.12 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  26.95 
 
 
587 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  30.56 
 
 
565 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>