32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4150 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  100 
 
 		 424 aa  832    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  87.31 
 
 		 386 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  96.63 
 
 		 385 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  87.56 
 
 		 386 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  95.08 
 
 		 386 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  95.08 
 
 		 386 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  94.3 
 
 		 386 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  87.82 
 
 		 386 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  86.27 
 
 		 386 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.54 
 
 		 393 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  72.48 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  73.48 
 
 		 373 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  71.58 
 
 		 385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.52 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  37.26 
 
 		 372 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  40.11 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  38.48 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  33.42 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  34.73 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  34.46 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.71 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  33.06 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.15 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  31.15 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.81 
 
 		 420 aa  134  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  32.78 
 
 		 377 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  32.52 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  33.57 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  28.95 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  28.43 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  34.27 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  31.94 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>