33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0508 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 385 aa  762    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  77.92 
 
 		 385 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  76.1 
 
 		 382 aa  594  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.72 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  70.81 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  69.27 
 
 		 386 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  69.27 
 
 		 386 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  70.16 
 
 		 386 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  69.27 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  69.52 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  70.67 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  70.08 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  70.4 
 
 		 386 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  69.13 
 
 		 373 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  38.16 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  38.9 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  39.21 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  34.21 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.02 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  34.25 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  33.75 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  31.13 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  32.15 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  32.24 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.7 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  30.79 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  31.23 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  30.65 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  28.16 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  32.99 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  30.9 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  37.82 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  27.94 
 
 		 586 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>