43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2933 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  100 
 
 
440 aa  881    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  40.71 
 
 
475 aa  256  4e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  37.12 
 
 
513 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  41.74 
 
 
349 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  36.07 
 
 
396 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  35.07 
 
 
371 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  35.69 
 
 
372 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.48 
 
 
399 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  36.99 
 
 
394 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  34.17 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  33.6 
 
 
377 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  34.46 
 
 
385 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  35.7 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  35.43 
 
 
386 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  34.39 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  34.01 
 
 
382 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  35.43 
 
 
386 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  35.34 
 
 
386 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  34.79 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  34.93 
 
 
386 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  34.93 
 
 
386 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  34.2 
 
 
424 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  32.47 
 
 
376 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 
393 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  33.6 
 
 
374 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  33.51 
 
 
373 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  35.95 
 
 
373 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.58 
 
 
385 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  33.91 
 
 
382 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  33.61 
 
 
367 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  33.33 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  42.98 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  24.21 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  26.28 
 
 
499 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  27.65 
 
 
527 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  27.48 
 
 
590 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0427  sulphate transporter  27.72 
 
 
493 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  28.65 
 
 
588 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  24.47 
 
 
519 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2191  sulphate transporter  25.24 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000878585  normal  0.36183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0815  sulphate transporter  24.84 
 
 
484 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0735  sulphate transporter  23.53 
 
 
554 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725862  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  23.6 
 
 
495 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>