40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0271 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  100 
 
 
396 aa  778    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  37.98 
 
 
371 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  34.79 
 
 
372 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  36.07 
 
 
440 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.49 
 
 
393 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.07 
 
 
399 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  33.95 
 
 
385 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  36.51 
 
 
385 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  33.93 
 
 
386 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  33.68 
 
 
386 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  33.42 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  32.98 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  33.16 
 
 
424 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  34.22 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  35.46 
 
 
373 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  35.75 
 
 
379 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  34.66 
 
 
386 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  34.66 
 
 
386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  34.5 
 
 
386 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  33.25 
 
 
386 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  29.87 
 
 
394 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.21 
 
 
385 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  32.14 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  32.3 
 
 
377 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  31.02 
 
 
513 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  29.27 
 
 
475 aa  146  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  34.1 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  32.71 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  29.84 
 
 
382 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  29.58 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  30.98 
 
 
367 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  26.21 
 
 
420 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  29.37 
 
 
556 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.46 
 
 
570 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  29.2 
 
 
499 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.57 
 
 
568 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0914  benzoate transporter  26.06 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000043909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  28.32 
 
 
500 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  28.32 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  28.8 
 
 
590 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>