32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0438 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  95.08 
 
 
424 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  87.56 
 
 
386 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  93.01 
 
 
385 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  87.82 
 
 
386 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  86.53 
 
 
386 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  98.7 
 
 
386 aa  742    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  100 
 
 
386 aa  751    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  98.96 
 
 
386 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  88.08 
 
 
386 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.7 
 
 
393 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  72.92 
 
 
385 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  72.58 
 
 
382 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  74.31 
 
 
373 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.27 
 
 
385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  38.08 
 
 
372 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  40.91 
 
 
373 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  38.78 
 
 
382 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  33.68 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.91 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  35.5 
 
 
440 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  34.21 
 
 
379 aa  162  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  37.47 
 
 
399 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  32.52 
 
 
374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  33.22 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  34.32 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  31.8 
 
 
349 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  32.64 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  31.48 
 
 
377 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  29.21 
 
 
513 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  33.56 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  28.5 
 
 
475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  30.93 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>