35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3181 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  100 
 
 		 373 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.19 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  73.48 
 
 		 385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  74.86 
 
 		 386 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  75.14 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  73.48 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  74.31 
 
 		 386 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  72.1 
 
 		 386 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  71.82 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  72.18 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  71.55 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  70.08 
 
 		 382 aa  484  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  68.32 
 
 		 385 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.13 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  36.83 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  37.36 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  38.93 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  32.98 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  34.23 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  34.22 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  33.96 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  36.22 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.44 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  33 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  33.51 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  33.7 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  30.69 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  31.92 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  33.33 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  28.22 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  28.07 
 
 		 513 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  31.77 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  29.11 
 
 		 749 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.02 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  24.49 
 
 		 563 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>