21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  213  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  46.6 
 
 		 213 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  46.6 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  47.06 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  37.96 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  39.81 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  35.85 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  38.53 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  33.94 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  28.26 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  30.49 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  34.02 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  31.11 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  27.96 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  28.05 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  26.83 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>