31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3913 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  77.32 
 
 
97 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  57.29 
 
 
97 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  64.58 
 
 
97 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  58.33 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  52.08 
 
 
97 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0029  GYD family protein  69.79 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0035  GYD family protein  69.79 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.161065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  50.52 
 
 
97 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0979  hypothetical protein  52.08 
 
 
97 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7354  hypothetical protein  47.42 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1787  hypothetical protein  44.79 
 
 
96 aa  94.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.777654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1507  hypothetical protein  48.39 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0673554  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  41.67 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  47.62 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  40.62 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  45.24 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  40.62 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  43.75 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  36.56 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  38.71 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  40.43 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1488  GYD family protein  35.42 
 
 
97 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0509  GYD family protein  31.82 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  30.34 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  31.87 
 
 
106 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  29.67 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  22.92 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  29.89 
 
 
97 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  26.37 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>