18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3120 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  224  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  78.5 
 
 
108 aa  183  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  75.7 
 
 
108 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  78.1 
 
 
115 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  76.64 
 
 
108 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  37.96 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  36.11 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  35.05 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  33.73 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  29.25 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  33.03 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  32 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  32.53 
 
 
213 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  30 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  32.99 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  30.67 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  30.16 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>