21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3666 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  86.79 
 
 
108 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  77.36 
 
 
108 aa  179  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  80.95 
 
 
108 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  78.1 
 
 
108 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  35.85 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  35.24 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  31.52 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  34.29 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  36.49 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  35.62 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  33.73 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  32.58 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  32.26 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  30.26 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  35.59 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  27.78 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  28.95 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  33.9 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  29.17 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>