20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1241 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  204  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  40.59 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  41.84 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  38.38 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  32.32 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  31.58 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  32.86 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  32.94 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  30.59 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  32.94 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  30.93 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  27.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  32 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>