21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0934 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  55.66 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  47.62 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  44.23 
 
 
213 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  40.57 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  42.31 
 
 
105 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  41.75 
 
 
114 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  45.54 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  35.19 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  34.26 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  33.33 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  34.29 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  33.33 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  33.73 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  34.12 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  29.41 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  30.59 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  32.94 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  29.41 
 
 
97 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>