16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2498 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  100 
 
 		 105 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  88.35 
 
 		 114 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  64.42 
 
 		 213 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  64.42 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  46.6 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  42.31 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  42.31 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  38.38 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  37.04 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  35.62 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  35.44 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  34.26 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  33.03 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  25.97 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  26.97 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>