20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2492 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  77.78 
 
 		 108 aa  183  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  75.7 
 
 		 108 aa  179  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  80.95 
 
 		 115 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  79.44 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  37.04 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  35.19 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  35.78 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  34.69 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  32.08 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  34.26 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  36.14 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  32 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  32 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  29.49 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  30.67 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  29.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  31.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>