16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0973 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  74.04 
 
 		 106 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  62.16 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  64.42 
 
 		 105 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  46.6 
 
 		 106 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  43.27 
 
 		 106 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  32.32 
 
 		 106 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  33.73 
 
 		 115 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  36.14 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  32.56 
 
 		 108 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  32.53 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  28.92 
 
 		 97 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  27.5 
 
 		 97 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>