32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4082 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  193  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  77.32 
 
 		 97 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  55.21 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  53.12 
 
 		 97 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  51.04 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  52.08 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  48.45 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7354  hypothetical protein  48.45 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0979  hypothetical protein  51.04 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1507  hypothetical protein  48.39 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0673554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  41.67 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0035  GYD family protein  56.25 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.161065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0029  GYD family protein  56.25 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1787  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.777654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  40.86 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  43.01 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  41.67 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  39.58 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  40.62 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  37.63 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1488  GYD family protein  33.33 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  32.14 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  31.91 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  23.96 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  26.97 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  29.63 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0509  GYD family protein  29.21 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  31.51 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  30.34 
 
 		 97 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  26.83 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>