34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6772 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  100 
 
 		 106 aa  222  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  83.02 
 
 		 106 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  70.1 
 
 		 97 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  64.95 
 
 		 97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  62.5 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  63.92 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  61.86 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  46.39 
 
 		 97 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  41.67 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  45.24 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7354  hypothetical protein  40.62 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  38.82 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1488  GYD family protein  39.58 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  39.53 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  36.46 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1507  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0673554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0979  hypothetical protein  42.71 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  35.48 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  37.11 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  36.46 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1787  hypothetical protein  35.05 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.777654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0035  GYD family protein  38.54 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.161065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0029  GYD family protein  38.54 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0509  GYD family protein  31.25 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  27.08 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  29.41 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  27.78 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  30.38 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  31.17 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1317  hypothetical protein  27.45 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5936  hypothetical protein  26.53 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>