22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1275 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  76.85 
 
 		 108 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  77.36 
 
 		 115 aa  179  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  79.44 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  76.64 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  38.53 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  34.26 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  37.04 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  29.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  37.27 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  32.41 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  34.07 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  38.55 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  30.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  30.67 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  30.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  31.17 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  29.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  29.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  28 
 
 		 97 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>