16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2353 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  88.35 
 
 		 105 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  62.75 
 
 		 213 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  59.22 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  47.06 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  41.75 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  41.84 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  32.41 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  36.49 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  32.63 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  28.74 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  32.08 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  24.64 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  31.51 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>