27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1084 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  74.04 
 
 		 213 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  64.42 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  59.22 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  39.62 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  40.57 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  35.78 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  28.26 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  37.27 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  34.41 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  32.65 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  32.26 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  26.51 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  33.77 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  29.03 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  26.19 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  29.27 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  26.09 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  25.3 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  30.3 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>