23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3475 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3475  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  215  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0934  hypothetical protein  55.66 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  52.38 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0973  GYD family protein  43.27 
 
 
213 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1084  hypothetical protein  39.62 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.307072  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2498  GYD family protein  42.31 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2353  hypothetical protein  42.72 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450376  normal  0.0588721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1241  hypothetical protein  40.59 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2492  GYD family protein  37.04 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3120  hypothetical protein  36.11 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  34.58 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  35.24 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  36.11 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  34.15 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  30.49 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  25.81 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  29.27 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  31.71 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  26.37 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  28.05 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  31.52 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  27 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>