28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1556 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  26.8 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  28.87 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  32.29 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  31.25 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  31.25 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  27.08 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  27.08 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  28.57 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  27.08 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7354  hypothetical protein  33.75 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  28.12 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0979  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0035  GYD family protein  30.93 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.161065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0029  GYD family protein  30.93 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0509  GYD family protein  28.87 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  23.96 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  26.8 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1200  hypothetical protein  33.8 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0664632  normal  0.476152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1488  GYD family protein  29.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1275  hypothetical protein  31.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1997  GYD family protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118052  normal  0.0506492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3666  GYD family protein  33.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1787  hypothetical protein  26.04 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.777654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>