30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2061 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2061  GYD family protein  100 
 
 		 97 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  hitchhiker  0.00211172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0133  hypothetical protein  55.67 
 
 		 97 aa  120  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2766  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3913  hypothetical protein  52.08 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4082  hypothetical protein  51.04 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244815  normal  0.462072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1821  GYD family protein  54.17 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0979  hypothetical protein  53.12 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1035  GYD family protein  43.75 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7354  hypothetical protein  42.71 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2222  GYD family protein  43.75 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2201  GYD family protein  41.67 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3680  GYD family protein  46.88 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0029  GYD family protein  52.58 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6772  GYD family protein  41.67 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0035  GYD family protein  52.58 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.161065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2955  GYD family protein  43.75 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1466  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6926  GYD family protein  44.79 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2697  GYD family protein  41.67 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.794289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1507  hypothetical protein  43.3 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0673554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4503  GYD family protein  41.84 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2176  hypothetical protein  44.79 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1787  hypothetical protein  36.46 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.777654 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1488  GYD family protein  40.4 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0806  GYD family protein  34.09 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1556  hypothetical protein  26.8 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200174  normal  0.832039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0352  GYD family protein  30.93 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0509  GYD family protein  29.9 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0264  hypothetical protein  27.96 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1200  hypothetical protein  29.17 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0664632  normal  0.476152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>