33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4100 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  95.76 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  95.76 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  58.58 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  55 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  47.5 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  42.37 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  38.17 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  44.29 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  40.25 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  41.89 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  41.3 
 
 		 235 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  41.03 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  42.62 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  42.15 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  42.62 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  40.98 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  44.5 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  40.16 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  45.79 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  42.62 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  41.7 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  41.78 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  40.49 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  44.86 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  37.66 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  40.83 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  36.96 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  35.9 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  28.41 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  29.05 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  42.67 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  28.49 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>