33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3009 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  62.21 
 
 
239 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  61.93 
 
 
239 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  52.07 
 
 
241 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  51.39 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  53.06 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  51.63 
 
 
239 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  50.91 
 
 
245 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  51.15 
 
 
235 aa  217  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  49.54 
 
 
241 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  52.31 
 
 
243 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  51.17 
 
 
240 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  50.23 
 
 
248 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  52.26 
 
 
245 aa  214  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  49.78 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  51.94 
 
 
251 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  49.77 
 
 
243 aa  208  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  51.28 
 
 
241 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  50.23 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  49.77 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  49.77 
 
 
239 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  49.25 
 
 
283 aa  181  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  44.21 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  45.95 
 
 
272 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  41.31 
 
 
236 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  41.78 
 
 
236 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  40.85 
 
 
236 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  37.77 
 
 
272 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  35 
 
 
258 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  25.91 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  28 
 
 
273 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  41.56 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  27.43 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>