33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0629 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  38.2 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  37.33 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  41.67 
 
 
250 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  41.67 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  41.03 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  38.71 
 
 
241 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  36.13 
 
 
245 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  37.39 
 
 
241 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  36.75 
 
 
243 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  41.67 
 
 
235 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  36.48 
 
 
241 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  39.72 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  36.68 
 
 
236 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  37.55 
 
 
236 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  36.96 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  39.78 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  37.78 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  37.63 
 
 
239 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  37.89 
 
 
218 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  37.27 
 
 
239 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  37.61 
 
 
241 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  39.3 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  39.3 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  41.08 
 
 
239 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  29.85 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  45.78 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  26.32 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  25.33 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  26.13 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>