33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0670 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  85.41 
 
 
239 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  84.12 
 
 
239 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  83.69 
 
 
239 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  71.19 
 
 
243 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  66.25 
 
 
241 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  64.17 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  64.34 
 
 
245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  63.67 
 
 
245 aa  301  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  63.75 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  68.52 
 
 
252 aa  299  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  63.33 
 
 
239 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  64.78 
 
 
235 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  65.92 
 
 
243 aa  294  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  63.75 
 
 
241 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  58.97 
 
 
248 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  54.87 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  55.31 
 
 
251 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  51.17 
 
 
218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  52.38 
 
 
239 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  45.7 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  43.29 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  40.34 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  44.29 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  42.02 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  38.78 
 
 
283 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  40.43 
 
 
272 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  38.36 
 
 
272 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  31.84 
 
 
258 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  30.7 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  39.78 
 
 
176 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  38.75 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>