33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1457 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  61.09 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  60.09 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  59.29 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  58.85 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  61.62 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  54.51 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  53.33 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  53.31 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  52.46 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  55.5 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  52.67 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  52.26 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  55.45 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  56.56 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  56.3 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  56.72 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  53.65 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  50.47 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  40.08 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  47.94 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  46.84 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  45 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  40.42 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  42.37 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  42.49 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  37.45 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  37.55 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  35.79 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  29.5 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  26.72 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  26.72 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  39.08 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>