33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4166 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  88.98 
 
 
241 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  86.94 
 
 
245 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  88.16 
 
 
241 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  86.12 
 
 
239 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  88.57 
 
 
241 aa  407  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  82.86 
 
 
241 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  70.32 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  65.27 
 
 
235 aa  311  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  64.78 
 
 
240 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  60.32 
 
 
243 aa  292  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  66.53 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  64.34 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  65.74 
 
 
252 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  65.29 
 
 
239 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  53.31 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  53.85 
 
 
250 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  53.42 
 
 
251 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  50.45 
 
 
218 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  44.55 
 
 
239 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  42.27 
 
 
239 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  40.16 
 
 
283 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  40.49 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  40.49 
 
 
236 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  41.58 
 
 
272 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  36.99 
 
 
235 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  36.13 
 
 
272 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  27.63 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  30 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  26.9 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  25.4 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  40.23 
 
 
176 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>