33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1178 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  100 
 
 
241 aa  483  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  92.95 
 
 
241 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  91.7 
 
 
241 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  90.46 
 
 
239 aa  440  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  87.76 
 
 
245 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  88.57 
 
 
245 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  86.72 
 
 
241 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  69.78 
 
 
243 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  64.98 
 
 
235 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  63.75 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  62.14 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  64.85 
 
 
239 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  66.67 
 
 
239 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  65.11 
 
 
239 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  65.26 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  53.65 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  54.51 
 
 
250 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  54.08 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  50.99 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  47.83 
 
 
239 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  45.15 
 
 
239 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  40.16 
 
 
283 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  41.15 
 
 
236 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  41.25 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  40.83 
 
 
236 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  42.63 
 
 
235 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  42.47 
 
 
272 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  37.61 
 
 
272 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  29 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  27.33 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  40.48 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  26.16 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>