33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1411 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  91.29 
 
 
241 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  90.61 
 
 
245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  90.04 
 
 
239 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  88.98 
 
 
245 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  92.95 
 
 
241 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  89.21 
 
 
241 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  66.81 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  76.65 
 
 
243 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  66.25 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  63.37 
 
 
243 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  66.11 
 
 
239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  67.08 
 
 
239 aa  281  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  67.09 
 
 
239 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  67.61 
 
 
252 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  53.33 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  52.99 
 
 
250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  52.56 
 
 
251 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  49.33 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  49.03 
 
 
239 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  46.12 
 
 
239 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  39.75 
 
 
283 aa  158  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  40.57 
 
 
236 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  40.33 
 
 
236 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  45.79 
 
 
236 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  43.01 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  38.49 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  36.48 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  32.47 
 
 
258 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  29.5 
 
 
278 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  27.17 
 
 
273 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  38.83 
 
 
176 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  26.63 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>