33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4497 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  96.6 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  55.14 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  53.6 
 
 
245 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  53.04 
 
 
243 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  53.88 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  53.88 
 
 
241 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  54.87 
 
 
240 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  58.79 
 
 
252 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  52.24 
 
 
241 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  53.25 
 
 
245 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  57.5 
 
 
241 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  57 
 
 
235 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  51.33 
 
 
243 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  52.87 
 
 
239 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  52.67 
 
 
239 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  52.05 
 
 
239 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  53.88 
 
 
241 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  48.2 
 
 
218 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  39.84 
 
 
239 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  46.19 
 
 
239 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  45.15 
 
 
235 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  39.54 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  39.24 
 
 
272 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  39.6 
 
 
236 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  40.27 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  40.24 
 
 
236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  35.68 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  32.67 
 
 
258 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  27.86 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  27.23 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  27.05 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  39.29 
 
 
176 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>