29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2766 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  37.16 
 
 
283 aa  84  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  39.09 
 
 
272 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  34.48 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  34.38 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  38.14 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  39.42 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  36.11 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  34.75 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  38.46 
 
 
236 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  35.19 
 
 
250 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  36.49 
 
 
241 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  41.56 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  37.07 
 
 
239 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  37.98 
 
 
245 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  34.25 
 
 
241 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  37.93 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  35.04 
 
 
243 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  36.78 
 
 
239 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  38.89 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  36.8 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  32.56 
 
 
273 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  32.87 
 
 
272 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  37.65 
 
 
243 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  38.82 
 
 
241 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  35.56 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>