33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1277 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  89.21 
 
 
241 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  86.31 
 
 
241 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  84.9 
 
 
245 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  84.23 
 
 
239 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  82.86 
 
 
245 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  86.72 
 
 
241 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  68.94 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  71.04 
 
 
243 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  67.27 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  61.73 
 
 
243 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  66.1 
 
 
239 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  65.82 
 
 
239 aa  275  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  64.98 
 
 
239 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  63.76 
 
 
252 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  51.85 
 
 
248 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  57.5 
 
 
250 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  57 
 
 
251 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  52.05 
 
 
218 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  51.05 
 
 
239 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  45.63 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  40.83 
 
 
236 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  39.08 
 
 
236 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  39.08 
 
 
236 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  42.05 
 
 
283 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  39.42 
 
 
235 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  43.01 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  38.2 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  34.62 
 
 
258 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  27.5 
 
 
278 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  25.54 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  38.82 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>