33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3721 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  73.66 
 
 		 235 aa  322  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  55 
 
 		 236 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  53.75 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  53.56 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  40.42 
 
 		 248 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  37.7 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  46.32 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  40.93 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  39.32 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  45.21 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  45.95 
 
 		 218 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  39.11 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  43.23 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  44.02 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  42.16 
 
 		 239 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  43.01 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  43.32 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  43.01 
 
 		 241 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  42.93 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  40.67 
 
 		 235 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  41.58 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  45.74 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  45.21 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  45.21 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  36.7 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  42.47 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  34.25 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  28.04 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  28.04 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  26.9 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  36.14 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>