33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2211 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2211  putative secreted protein  100 
 
 
239 aa  474  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2377  hypothetical protein  98.74 
 
 
239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.651912  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0966  hypothetical protein  96.65 
 
 
239 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0670  putative secreted protein  85.78 
 
 
240 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2842  putative secreted protein  72.38 
 
 
243 aa  331  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0530  hypothetical protein  71.76 
 
 
252 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1411  putative secreted protein  66.11 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.968662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2333  hypothetical protein  67.49 
 
 
245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000189055  unclonable  0.000000195999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1641  putative secreted protein  67.86 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3411  putative signal peptide  67.09 
 
 
241 aa  305  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162389  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0451  putative secreted protein  66.38 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1277  putative secreted protein  69.41 
 
 
241 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0499765  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4166  putative secreted protein  64.34 
 
 
245 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.571392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1198  hypothetical protein  64.85 
 
 
239 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1178  putative secreted protein  64.85 
 
 
241 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1457  hypothetical protein  56.72 
 
 
248 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.914801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4497  hypothetical protein  52.99 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59650  hypothetical protein  59.8 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000181371  hitchhiker  1.2953600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3009  hypothetical protein  49.77 
 
 
218 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3302  hypothetical protein  52.66 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2931  hypothetical protein  47.21 
 
 
239 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0322  hypothetical protein  43.04 
 
 
236 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4100  hypothetical protein  42.62 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0641  hypothetical protein  41.2 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4183  hypothetical protein  41.77 
 
 
236 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1747  hypothetical protein  37.14 
 
 
283 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3721  hypothetical protein  45.21 
 
 
272 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0629  hypothetical protein  41.3 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3940  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2381  hypothetical protein  29.61 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1071  hypothetical protein  31.07 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1033  hypothetical protein  28.37 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2766  hypothetical protein  43.02 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>