58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2273 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2273  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34882  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20840  aryl carrier domain protein  45.45 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  decreased coverage  0.00638863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  35.62 
 
 
297 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  41.43 
 
 
293 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3692  phosphopantetheine-binding protein  45.45 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  45.31 
 
 
291 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  46 
 
 
291 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.33 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  38.03 
 
 
84 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  38.71 
 
 
296 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  39.34 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  35.14 
 
 
2230 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 
1174 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  34.72 
 
 
2350 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  39.39 
 
 
285 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  37.88 
 
 
2174 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  40.82 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  40.82 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  40.82 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  40.82 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  32.91 
 
 
297 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  34.92 
 
 
1678 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  40.38 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  40.38 
 
 
284 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  36.49 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  40.43 
 
 
1131 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  36.73 
 
 
283 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  31.88 
 
 
284 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  37.25 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  44.59 
 
 
327 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  31.82 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  38.78 
 
 
285 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3616  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  34.18 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  31.82 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  31.82 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  31.82 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  31.65 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  31.65 
 
 
297 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  32.31 
 
 
295 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  36.9 
 
 
270 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  32.31 
 
 
295 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  32.86 
 
 
2258 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  29.85 
 
 
2057 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  36.67 
 
 
1149 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 
1163 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  33.8 
 
 
1414 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  38.78 
 
 
291 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  27.78 
 
 
1158 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  39.58 
 
 
291 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>