170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0247 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  100 
 
 
128 aa  263  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  71.88 
 
 
128 aa  207  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2587  ApaG  68.75 
 
 
128 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0017  ApaG  61.72 
 
 
128 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0222  ApaG  60.16 
 
 
128 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578122  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1758  ApaG  44.53 
 
 
128 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  46.67 
 
 
127 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12178  hypothetical protein  46.09 
 
 
128 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  47.93 
 
 
127 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  47.58 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  46.77 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  46.77 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  42.98 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  45.45 
 
 
127 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  42.97 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  45.83 
 
 
129 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  42.98 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  42.86 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  46.28 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  44.83 
 
 
127 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  41.94 
 
 
144 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  44.83 
 
 
127 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  40.94 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  42.19 
 
 
125 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  40.8 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  42.15 
 
 
137 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  41.6 
 
 
130 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  43.41 
 
 
125 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  43.9 
 
 
130 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  42.62 
 
 
158 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  40.32 
 
 
237 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  39.37 
 
 
130 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  40.32 
 
 
172 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  43.33 
 
 
124 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  44.64 
 
 
135 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  41.6 
 
 
130 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  40.8 
 
 
130 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  41.6 
 
 
130 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  43.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  43.36 
 
 
131 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  41.94 
 
 
130 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  40.94 
 
 
126 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  42.4 
 
 
130 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  42.15 
 
 
127 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  40.3 
 
 
133 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  41.13 
 
 
140 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  41.6 
 
 
130 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  41.94 
 
 
130 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  40.94 
 
 
126 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  43.12 
 
 
134 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  42.86 
 
 
136 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  41.13 
 
 
128 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1874  ApaG  44.54 
 
 
139 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.013678  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  41.67 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  42.62 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  39.37 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  41.03 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  40 
 
 
126 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  43.44 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  42.24 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  42.62 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  45.28 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  40.32 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  45.71 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  43.8 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  39.32 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  42.62 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  42.74 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  40 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  39.52 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  42.5 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  40 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  43.75 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  40.32 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  40.98 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  42.15 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  39.52 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  41.94 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  40.65 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  42.37 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  40 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  41.53 
 
 
185 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  41.53 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  41.67 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  40 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  41.53 
 
 
127 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  38.14 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  41.53 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  41.53 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  42.86 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>