170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0189 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  100 
 
 
130 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  96.15 
 
 
130 aa  259  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  79.23 
 
 
130 aa  224  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  78.46 
 
 
130 aa  223  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  66.92 
 
 
130 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  63.85 
 
 
130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  63.85 
 
 
141 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  61.54 
 
 
130 aa  173  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  60.77 
 
 
144 aa  170  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  55.38 
 
 
140 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  56.15 
 
 
130 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  54.62 
 
 
145 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  50.77 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  57.25 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  52.31 
 
 
130 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  55.38 
 
 
140 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  53.08 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  53.08 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  53.08 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  51.54 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  51.54 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  51.54 
 
 
130 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  50.77 
 
 
130 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  51.91 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  51.91 
 
 
237 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  52.03 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  52.03 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  52.5 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  52.1 
 
 
211 aa  129  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  47.97 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  47.69 
 
 
154 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  52.14 
 
 
157 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  51.24 
 
 
129 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  53.33 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  49.59 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  49.58 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  49.58 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  47.97 
 
 
130 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  50.83 
 
 
142 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  48.72 
 
 
125 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  49.15 
 
 
127 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  47.37 
 
 
131 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  45 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  48.74 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  45 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  45 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  47.97 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  44.72 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  45.38 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  47.01 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  45 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  47.11 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  45 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  47.11 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  47.9 
 
 
135 aa  116  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  47.15 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  47.37 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  47.83 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  46.15 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  47.83 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  46.34 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  44.54 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  45 
 
 
126 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  47.5 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  46.22 
 
 
133 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  45.3 
 
 
125 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.15 
 
 
125 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  46.77 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  43.48 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  47.06 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  46.15 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  44 
 
 
126 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  45.38 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  48.31 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  47.71 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  45.22 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  44.54 
 
 
126 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>