169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2889 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2889  ApaG  100 
 
 
126 aa  260  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  68.91 
 
 
126 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  63.33 
 
 
128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  61.16 
 
 
126 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  58.73 
 
 
126 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  58.73 
 
 
126 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  58.73 
 
 
126 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  58.73 
 
 
126 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  57.94 
 
 
126 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  57.94 
 
 
126 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  57.94 
 
 
126 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  61.67 
 
 
126 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  57.94 
 
 
126 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  57.14 
 
 
126 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  57.5 
 
 
126 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  55.83 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  47.5 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  50.43 
 
 
211 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  48.8 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  48.31 
 
 
125 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  46.03 
 
 
126 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  48.31 
 
 
125 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  46.4 
 
 
126 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  47.9 
 
 
125 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  47.97 
 
 
125 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  46.4 
 
 
126 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  47.83 
 
 
131 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  45 
 
 
130 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  45.38 
 
 
125 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  47.5 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  44.17 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  48.74 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  49.57 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  47.5 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  49.57 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.61 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  45.38 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.38 
 
 
125 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  47.06 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  47.83 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  45.83 
 
 
130 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  48.74 
 
 
125 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  47.83 
 
 
145 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  48.74 
 
 
125 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  48.74 
 
 
125 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  48.74 
 
 
125 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  48.74 
 
 
125 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  48.33 
 
 
125 aa  116  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  46.96 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  46.22 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  44.17 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  44.54 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  47.06 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  42.02 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  46.09 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  47.83 
 
 
130 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  44.17 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  46.22 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  42.86 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  45.38 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  47.41 
 
 
237 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  47.83 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  47.83 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  45.69 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  47.83 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  46.55 
 
 
172 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  42.06 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  44.44 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  42.86 
 
 
127 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  48.28 
 
 
144 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  45.22 
 
 
130 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  42.06 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  43.59 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  45.05 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  46.09 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  42.5 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  43.9 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  43.9 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  47.41 
 
 
130 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  40.48 
 
 
126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  48.7 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  40.48 
 
 
126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  40.48 
 
 
126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  46.03 
 
 
142 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  43.97 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  42.28 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  42.86 
 
 
126 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  41.13 
 
 
124 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  41.13 
 
 
124 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  47.83 
 
 
141 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>